3000万年前，黑暗使世界陷入恐惧。 最终光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。 光之巨人也用尽了全力，在红色的星球上陷入长眠。 时光流转，在地球和平同盟TPU紧急组建精英小组“GUTS-SELECT”时，主人公真中剑悟正在刚刚开拓的火星上作为植物学家安稳地生活着。 但是有一天，超古代封印的黑暗突然再次来袭，打破了安稳宁静的生活。 当火星的街道被怪物破坏时，剑悟被命运引导，和沉睡的光之巨人相遇了。 这次相遇会给他和地球带来怎样的影响呢？ 跨越时空苏醒的光之巨人，其名为——特利迦奥特曼。
在AR技术发展成熟的现代，作为发展技术的MR-Mixed reality system设备被普遍应用的社会。MR技术被广泛运用，作为女子高中生为中心的新型运动，名字叫做Circlet Bout。作为人气运动的Circlet Bout不仅是在学园内，甚至是整个区域内都不断的被作为娱乐而泛用，最受瞩目的
“这世界真是糟透了。”脱离工薪族变成尼特的盛冈森子，为了追求充实的生活而出发前往网络世界。她到达的地方，是网络游戏——通称“网游”。在网游世界中，以有着一头柔顺头发的爽朗帅哥“林”的身份开始新生活的森子。就在她完全暴露是菜鸟而自暴自弃时，一位可爱的少女“莉莉”向她伸出了援助之手。“天使啊——！！！！”以遇到莉莉为契机，她交到了值得信赖的同伴，开始过起充实的网游生活。此时，在现实世界中，她与神秘的金发碧眼帅哥精英公司职员樱井优太冲击性地相遇了。
2031年，由于作为次世代能量装置而开发的“量子反应堆”的暴走事故，世界剧变。突然从地下蔓延的闪光，吞噬都市楼群、覆盖大地，最终，超越、融合了生物、机械、植物的未知特异进化生物“B.R.A.I”出现了。 7年后，翔龙重生为绝对防卫都市“新翔龙”。它以惊人的速度完成进化，并成为与陷人类于灭亡危机的B.R.A.I相对抗的人类最后的希望要塞。 被命运所引导而集合在新翔龙的雷昂、可依、坤灵、道格。将他们迎入防卫军的塞西尔、凯恩、杰、格伦。于是，赌上人类存亡而战的特殊部队“潘多拉”诞生了。 契约之时，希望被托付给了他们——
