阳光明媚、寂静平和的海滩，一群小海龟孵化出壳，他们摆动着稚嫩的臂膀，奋力向大海爬去。名叫萨米（比利·安格 Billy Unger 配音）的小海龟最后爬出蛋壳，但是他怎么也无法爬出沙坑。焦急时分，塞米更被海鸟捉到空中，眼看就成为了对方的点心。混乱之际，他结识了美丽的女孩莎莉（伊莎贝拉·弗尔曼 Isabelle Fuhrman 配音）。此后，他乘坐轮船的碎木板像海洋中心飘去，偶然遇到了他一生的好朋友雷。 在此后的50年里，两个小家伙乘坐破木板周游世界，见识了海洋各处的美景奇观，也经历着人类为了私欲对海洋做出的无可弥补的破坏，他们的冒险从未结束……
当艾伦释放出巨人的终极力量时，世界的命运岌岌可危。怀着消灭所有威胁艾尔迪亚的人的强烈决心，他率领一支不可阻挡的巨人大军向马莱进击。
神龙大侠阿宝（杰克·布莱克 Jack Black 配音）再度归来，要被师父（达斯汀·霍夫曼 Dustin Hoffman 配音）强行进阶修行。系列全新最强反派魅影妖后（维奥拉·戴维斯 Viola Davis 配音）登场，神秘莫测的她可以幻化成每一个阿宝的昔日宿敌。此次阿宝又结识了小真（奥卡菲娜 Awkwafina 配音）等新伙伴，并将一同开启这场冒险旅程。
